Methanohalophilus mahii
| Methanohalophilus mahii | ||
|---|---|---|
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| Taxonomía | ||
| Dominio: | Archaea | |
| Filo: | Euryarchaeota | |
| Clase: | Methanosarcinia | |
| Orden: | Methanosarcinales | |
| Familia: | Methanosarcinaceae | |
| Género: | Methanohalophilus | |
| Especie: |
M. pomorum Paterek y Smith 1988 | |
Methanohalophilus mahii es una especie de arquea metilotrófica, halófila, y metanógena.[1] Su genoma se ha secuenciado.[2] Es especies estrictamente anaerobia y viven exclusivamente mediante la producción de metano. Methanohalophilus mahii fue aislado por primera vez del Gran Lago Salado en Utah.[3] Se encuentrado en ambientes acuáticos de alta salinidad.[4] El nombre Methanohalophilus es de methanum que significa "metano" en idioma latín; halo que significa "sal" en idioma griego; y mahii que significa "de Mah" en latín, sobre R.A. Mah, quien hizo una gran cantidad de investigaciones sobre microbios aeróbicos y metanogénicos.[5] El tipo de cepa específico se designó como SLP (= ATCC 35705) y actualmente es la única cepa identificada de esta especie.[5]
Phylogeny
[editar]En todo, son cuatro especies en el género Methanohalophilus, incluso Methanohalophilus mahii, Methanohalophilus halophilus, Methanohalophilus portucalensis, y Methanohalophilus euhalobius.[4] El pariente más cercano, Methanohalophilus portucalensis, tiene una similitud del 99,8% en la secuencia en todo el genoma a Methanohalophilus mahii.[4] Las otras especies de Methanohalophilus tiene menos de 94.7% similitud a Methanohalophilus mahii.[4] Todas especies dentro del género son halófilas, metanogenas que contribuyen a ecosistemas marinos y ciclismo mineral.[4]
Descubrimiento
[editar]En 1988, Robert Paterek y Paul Smith estaban buscando bacterias metanogénicas en el Gran Lago Salado en Utah cuando descubrieron por primera vez la archaeon Methanohalophilus mahii en sus sedimentos anóxicos.[5] Las muestras de sedimento se recogieron y almacenaron en tubos de plexiglás, y las muestras de subnúcleo se tomaron con un taladro de corcho de bronce y se transfirieron a botellas de suero de cincuenta mililitros.[6] Todas las muestras se procesaron dentro de las cuarenta y ocho horas posteriores a la recolección.[6] Los medios utilizados para el aislamiento de las colonias de Methanohalophilus mahii se prepararon utilizando la técnica de Hungate para el aislamiento adecuado de los microbios anaerobios.[6] Las diluciones en serie se prepararon en una proporción de 1:10,[6] y los tubos de rollo de agar se inocularon y se incubaron a 30.oC durante ocho semanas.[6] Las colonias metanógenas aisladas se eligieron al identificar aquellas con una textura espumosa, que denota liberación de gas,[4] y se diluyeron e inocularon repetidamente en tubos con tubos de agar hasta que solo quedó un tipo de morfología de colonia.[6] Estas colonias aparecieron como colonias de color amarillo pálido de color crema a amarillo pálido con una textura espumosa general debido a la liberación de gas.[5]
Cultivo celular
[editar]Se realizaron varios análisis para determinar las características de las células.[6] Methanohalophilus mahii Methanohalophilus mahii se clasifica como halófilo moderado, o un organismo que puede crecer en ambientes de alta salinidad, ya que puede crecer en un rango de 0.5 a 3.5 M de NaCl[4] con una concentración de crecimiento óptima a 2.0 M de NaCl,[4] pero con una concentración de NaCl 1,2 M que produce la densidad de cultivo más alta.[4] También puede crecer en diferentes niveles de pH que van desde 6.5 hasta 8.2,[4] con un pH óptimo de 7.5.[4] Methanohalophilus mahii es un mesófilo, o un organismo que prospera a temperaturas moderadas, y crece mejor a una temperatura de 37.oC.[5]
Estructura celular
[editar]Methanohalophilus mahii cells macha Gram negativa,[4] y no son móviles.[5] Las celdas son irregulares y cocos[5] aproximadamente 0.8 a 1.8 micrómetros de diámetro.[5] Además, las células fluorescen bajo luz de 420 nanómetros.[5] Los fosfolípidos de membrana están compuestos por núcleos de β-hidroxiaarol, glicolípidos de glucosa y grupos de cabeza polares de etanolamina, glicerol y mioinositol.[4]
Metabolismo
[editar]Methanohalophilus mahii es un anaeróbico anaeróbico [1] metilotrófico[4] metilotrofoic[5] y metanógena quimioheterótrofo, y puede reducir compuestos de un solo carbono y compuestos con múltiples carbonos dado que no hay dobles enlaces carbono-carbono presentes.[4] Se requieren cantidades traza de Mg2 +, K +, Ca2 + y Fe2 + para el crecimiento metanogénico.[4] Pueden usar metanol de forma independiente como fuente de carbono, y la vía glucolítica Embden-Meyerhof-Parnas (EMP) se puede utilizar para procesos catabólicos.[4] Donantes de electrones posibles incluyen metanol, metilaminas, dimetilaminas y trimetilaminas.[4] Methanohalophilus mahii puede usar varias vías metabólicas para reducir o oxidar los grupos metilo, creando metano o dióxido de carbono en el proceso.[4] En la vía metanógena metilotrófica reductiva, Methanohalophilus mahii finalmente puede reducir un grupo metilo a un metano, que se libera.[4] n la ruta oxidativa metilotrófica, el grupo metilo se oxida en cambio a dióxido de carbono y se libera.[4] Este proceso contribuye directamente a la mineralización de carbono en los ecosistemas marinos.[4]
Genoma
[editar]La genoma de Methanohalophilus mahii fue secuenciado por secuencia de escopeta using a 6.8 kilobase biblioteca Sanger.[4] Se determinó que el tamaño completo del genoma es de 2.012.424 pares de bases de longitud, con 2.906 genes en total, con 2.032 genes que codifican proteínas.[7] La secuencia tenía un 42.6% contenido GC, y cuarenta y cinco pseudogenes estaban ubicados.[4]
Significado
[editar]Methanohalophilus mahii tiene un único ARNt supresor con una pirrolisina, un aminoácido que se encuentra más comúnmente en procariotas, que puede reconocer y unirse al codón de PARADA ámbar (UAG) que también está codificado por los genes utilizados para metilamina metiltransferasas.[7] Esta especie fue la primera del género Methanohalophilus tener su genoma completamente secuenciado [1] </ span>]]. Tiene especies levemente halófilas, metilotrofas, y metanógenas.[7] Estas arqueas contribuyen al proceso de carbono mineralización en el medio marino ecosistemas.[7] Específicamente, la ruta oxidativa metilotrofa Methanohalophilus mahii utiliza permite a la especie oxidar metano a dióxido de carbono, que, a su vez, es utilizado por otros planta sy organismo s.[7] This mineral ciclo proceso permite un mayor crecimiento y diversidad en el océano.[4]
Referencias
[editar]- ↑ Paterek, J. R.; Smith, P. H. (1988). «Methanohalophilus mahii gen. nov., sp. nov., a Methylotrophic Halophilic Methanogen». International Journal of Systematic Bacteriology 38 (1): 122-123. ISSN 0020-7713. doi:10.1099/00207713-38-1-122.
- ↑ Spring, Stefan; Scheuner, Carmen; Lapidus, Alla; Lucas, Susan; Glavina Del Rio, Tijana; Tice, Hope; Copeland, Alex; Cheng, Jan-Fang; Chen, Feng; Nolan, Matt; Saunders, Elizabeth; Pitluck, Sam; Liolios, Konstantinos; Ivanova, Natalia; Mavromatis, Konstantinos; Lykidis, Athanasios; Pati, Amrita; Chen, Amy; Palaniappan, Krishna; Land, Miriam; Hauser, Loren; Chang, Yun-Juan; Jeffries, Cynthia D.; Goodwin, Lynne; Detter, John C.; Brettin, Thomas; Rohde, Manfred; Göker, Markus; Woyke, Tanja; Bristow, Jim; Eisen, Jonathan A.; Markowitz, Victor; Hugenholtz, Philip; Kyrpides, Nikos C.; Klenk, Hans-Peter (2010). «The Genome Sequence of Methanohalophilus mahii SLPT Reveals Differences in the Energy Metabolism among Members of the Methanosarcinaceae Inhabiting Freshwater and Saline Environments». Archaea 2010: 1-16. ISSN 1472-3646. PMC 3017947. PMID 21234345. doi:10.1155/2010/690737.
- ↑ Koki Horikoshi; Garabed Antranikian; Alan T. Bull; Frank T. Robb; Karl O. Stetter, eds. (8 de diciembre de 2010). Extremophiles Handbook. Springer Science and Business Media. p. 260. ISBN 4431538976. Consultado el 8 de agosto de 2016.
- ↑ a b c d e f g h i j k l m n ñ o p q r s t u v w x Spring, S.; Scheuner, C.; Lapidus, A.; Lucas, S.; Rio, T. G. D.; Tice, H.; Copeland, A.; Cheng, J. et al. (23 de diciembre de 2010). «The Genome Sequence of Methanohalophilus mahii SLPT Reveals Differences in the Energy Metabolism among Members of the Methanosarcinaceae Inhabiting Freshwater and Saline Environments». Archaea (en inglés) 2010: 1-16. ISSN 1472-3646. PMC 3017947. PMID 21234345. doi:10.1155/2010/690737.
- ↑ a b c d e f g h i j Paterek, J. R.; Smith, P. H. (1 de enero de 1988). «Methanohalophilus mahii gen. nov., sp. nov., a Methylotrophic Halophilic Methanogen». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 38 (1): 122-123. doi:10.1099/00207713-38-1-122.
- ↑ a b c d e f g Paterek, J. Robert; Smith, Paul H. (1 de octubre de 1985). «Isolation and Characterization of a Halophilic Methanogen from Great Salt Lake». Applied and Environmental Microbiology 50 (4): 877-881. ISSN 0099-2240. PMC 291763. PMID 16346919.
- ↑ a b c d e Error en la cita: Etiqueta
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Otras lecturas
[editar]- Dworkin, Martin, and Stanley Falkow, eds. The Prokaryotes: Vol. 3: Archaea. Springer, 2006.
- Spring, Stefan; Lapidus, Alla; Scheuner, Carmen (2010). «The Genome Sequence of Methanohalophilus mahii SLPT Reveals Differences in the Energy Metabolism among Members of the Methanosarcinaceae Inhabiting Freshwater and Saline Environments». Archaea 2010: 16. PMC 3017947. PMID 21234345. doi:10.1155/2010/690737.
